Mankomunitatea honako gobernu-organoek osatzen dute:
- Batzar orokorra, 12 zinegotzik osatua (udalerriko 2).
- Gobernu-batzordea, 6 ordezkariz osatua (udalerriko 1).
- Lehendakaria eta lehendakariordea.
- Bestelako organo osagarriak (lan-mahaiak).
2023-2027 legealdian, Hernaniko Udaleko zinegotzia den Patxi Ibarguren Etxeberria andrea da lehendakaria eta, lehendakariordea, Andoaingo Udaleko zinegotzia den Jose Mari Iparraguirre Balda.